核心提示：10月26日，學術期刊NEW PHYTOLOGIST在線發表了華中農大園藝林學學院葉志彪教授團隊的一篇題為Expression and diversification analysis reveals transposable elements play important roles in the origin of Lycopersicon-specific lncRNAs in tomato（轉座子在番茄特有lncRNAs的進化形成中發揮重要作用）的研究論文。

番茄是一種重要的園藝作物和果實成熟發育的模式作物，通過變異和進化分析，許多與農藝學相關的重要編碼基因都得到了深入研究，但學界對于番茄中長鏈非編碼RNA的起源及其功能卻尚不清楚。10月26日，學術期刊NEW PHYTOLOGIST 在線發表了華中農大園藝林學學院葉志彪教授團隊的一篇題為Expression and diversification analysis reveals transposable elements play important roles in the origin of Lycopersicon-specific lncRNAs in tomato（轉座子在番茄特有lncRNAs的進化形成中發揮重要作用）的研究論文。

該研究通過生物信息學手段，對栽培番茄和其近緣野生種醋栗番茄的長鏈非編碼RNA進行了預測和表達分析。分析表明，長鏈非編碼RNA的表達具有明顯的時空特異性，生殖器官與其他組織相比具有更多的特異表達的長鏈非編碼RNA。通過與野生潘那利番茄進行比較發現，長鏈非編碼RNA在不同的番茄種間變異很大，轉座子導致的結構變異是造成長鏈非編碼RNA低保守性的一個重要原因。研究團隊通過對一個果實破色特異表達的長鏈非編碼RNA進行深入分析，證明了該長鏈非編碼RNA的起源經歷了兩次主要的進化事件，即LTR反轉座子的插入和大片段的丟失。經過共表達分析，團隊發現位于該長鏈非編碼RNA上游的一個編碼基因可能是該長鏈非編碼RNA的靶基因，該長鏈非編碼RNA可能通過調控靶基因的表達，進而調控番茄果實的發育成熟。

該論文第一作者為園林院博士研究生王昕，葉志彪教授和張俊紅教授為通訊作者。據悉，該課題組正在深入研究長鏈非編碼RNA及其靶基因在番茄果實成熟中的作用，研究受到國家自然科學基金和國家重點基礎研究發展計劃（973）的資助。

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