“閩臺高校教育交流與合作”被列為福建省教育改革試點之一，福建將加快建設兩岸教育合作實驗園區，建立兩岸職業教育教學資源基地、兩岸職業教育師資培訓基地，探索推動閩臺高校學生互招、學歷學分互認、師資互聘的新辦法，為推動兩岸高等教育交流合作提供新模式和新經驗。

為兩岸高等教育交流合作探索創新與示范輻射基地的兩岸教育合作實驗園區，目前已經在福州地區大學新校區和平潭綜合實驗區啟動建設。福州大學、福建師范大學、福建中醫藥大學等與臺灣有關高校聯合創辦的“海峽理工學院”、“海峽學院”、“健康學院”入駐平潭綜合實驗園區，福建農林大學與臺灣高校的首批合作辦學項目入駐福州地區大學新校區，將積極探索兩岸高校聯合培養高層次應用型、技能型人才和聯合開展高水平科技研究的新模式、新機制。

同時，根據閩臺產業發展需求，福建將繼續組織福建高校在制造業、電子通訊業、建筑業、旅游業、現代農業等緊缺人才培養領域與臺灣高校和相關臺資企業開展實質性合作，聯合培養一批高素質的技能型人才。2011年，閩臺高校聯合培養人才項目共27所院校的142個專業獲批，招生計劃為6000人。

《福建省教育改革試點總體方案》中明確指出，力爭到2012年，閩臺兩地聯合開展試點的高校達到60所，其中有5所以上的臺灣高水平大學與福建高校開展實質性的教育交流合作；參加試點的臺資企業達到60家，聯合培養學生達到1.5萬名，聯合培訓師資3000余人，聯合編寫教材60本，聯合開展專項課題研究40項。到2015年，力爭在合作辦學，共建科學研究中心、科技成果轉化(育成)中心，聯合培養高層次應用型、技能型人才和聯合開展高水平科學研究等方面取得突破。

此外，廈門大學將開展閩臺高校教育交流與合作綜合改革試點，積極發起或參與組織兩岸高校聯盟，引導、幫助臺灣高校與內地高校在廈門、金門、平潭等地開展合作辦學；加大對臺招生工作力度，吸引更多臺灣優質生源來校接受學歷教育。

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