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復旦大學研究團隊提出H7N9禽流感病毒起源新說

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復旦大學研究團隊提出H7N9禽流感病毒起源新說

復旦大學公共衛生學院青年教師熊成龍、張志杰等以生物信息學為手段,對本次H7N9禽流感病毒基因進行研究和分析,找到了該病毒的起源和演化規律,即首次發現該病毒的兩個最重要蛋白HA和NA并非如此前中外學術界專家所認為的“分別來源于中國和韓國禽類”,而是起源于中國華東地區的家禽或野鳥。該成果對今后預防和溯源流感與禽流感有重要意義,近日,相關論文已在線發表在國際傳染病領域著名期刊美國《臨床感染病》(Clinical Infectious Diseases)雜志。

據悉,2月19日起,我國華東地區陸續出現系列流感樣病例,3月31日,國家衛生與計劃生育委員會通報確認感染病原為新型H7N9亞型禽流感病毒。對于該病毒的起源,中外學術界專家普遍認為來自中韓禽類,他們認為根據采集到的1株H7亞型HA(即H7N3病毒)來源于中國杭州的杭州鴨,采集到的7株N9亞型NA(即H7N9病毒)則來源于韓國禽類。

熊成龍、張志杰研究團隊認同中外學術界專家對HA來源的報道,但對NA來源則有異議。

核苷酸是構成基因的最基本單位,氨基酸是構成蛋白的最基本單位,對核苷酸和氨基酸的同源進行分析,就能夠搞清楚病毒的起源和演化規律。為此,熊成龍、張志杰研究團隊分析了全球共享的流感數據庫中(包括本次病原代表株H7N9病毒以及2006~2011年的7株韓國株NA亞型株在內)長度大于1000核苷酸的N9基因序列共321個NA序列,并由此推導出相應的蛋白質氨基酸序列,最終證實,H7N9禽流感病毒的最重要蛋白HA(N9基因)來源于中國江蘇洪澤湖花臉鴨(即H11N9病毒株),即NA蛋白并非來源于韓國。

熊成龍、張志杰研究團隊認為最重要的依據是,從基因的核苷酸和蛋白質氨基酸序列相似性搜索結果來看,H7N9病毒的最重要蛋白NA與H11N9病毒在核苷酸和氨基酸層次上序列的相似性分別是96.2%和96.8%;而7株韓國株NA亞型株相似性分別在93.3%至95.5%和87.9%至96.4%。前者遠高于后者。

熊成龍、張志杰研究團隊研究還認為,杭州是H7N3病毒的分離地,也是本次流感流行的主要疫區之一,洪澤湖是中國第4大淡水湖,是水禽的主要棲息地之一,也是H11N9病毒的分離地,也就是說,從本次流感最初發生地、H7亞型HA貢獻株分離地以及H11N9病毒分離地點來看,均位于中國的華東地區,從地理位置上來看,病毒株發生重組的可能性也遠高于韓國株。

據悉,這一發現將為準確推斷流感病毒的起源與演化規律提供必要理論依據,同時為進一步研究流感病毒的傳播與流行規律,早期預警流感傳播,進而采取積極有效的預防控制策略等有指導意義。

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